MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidiphilium multivorum AIU301 plasmid pACMV1

Total Repeats: 5513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015178	TCGCC	2	10	166383	166392	0 %	20 %	20 %	60 %	325113165
3502	NC_015178	C	6	6	166391	166396	0 %	0 %	0 %	100 %	325113165
3503	NC_015178	GTC	2	6	166397	166402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113165
3504	NC_015178	CGGCG	2	10	166432	166441	0 %	0 %	60 %	40 %	325113165
3505	NC_015178	CGGA	2	8	166451	166458	25 %	0 %	50 %	25 %	325113165
3506	NC_015178	CCG	2	6	166517	166522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113165
3507	NC_015178	TCG	2	6	166575	166580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113165
3508	NC_015178	ATCG	2	8	166630	166637	25 %	25 %	25 %	25 %	325113165
3509	NC_015178	CAA	2	6	166662	166667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325113165
3510	NC_015178	AC	3	6	166719	166724	50 %	0 %	0 %	50 %	325113165
3511	NC_015178	AGTC	2	8	166725	166732	25 %	25 %	25 %	25 %	325113165
3512	NC_015178	GCG	2	6	166797	166802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113165
3513	NC_015178	GCGA	2	8	166826	166833	25 %	0 %	50 %	25 %	325113165
3514	NC_015178	GCCG	2	8	166843	166850	0 %	0 %	50 %	50 %	325113165
3515	NC_015178	CAT	2	6	166866	166871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325113165
3516	NC_015178	GCAC	2	8	166904	166911	25 %	0 %	25 %	50 %	325113165
3517	NC_015178	ATC	2	6	166916	166921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325113165
3518	NC_015178	TCA	2	6	167016	167021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325113165
3519	NC_015178	CAC	2	6	167113	167118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325113165
3520	NC_015178	GCCCG	2	10	167148	167157	0 %	0 %	40 %	60 %	325113165
3521	NC_015178	TTC	2	6	167246	167251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325113165
3522	NC_015178	CGC	2	6	167385	167390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113165
3523	NC_015178	TCG	2	6	167418	167423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113165
3524	NC_015178	CCGC	2	8	167926	167933	0 %	0 %	25 %	75 %	325113166
3525	NC_015178	GGC	2	6	167991	167996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113166
3526	NC_015178	CGC	2	6	168079	168084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113166
3527	NC_015178	GCC	2	6	168107	168112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113166
3528	NC_015178	GC	4	8	168152	168159	0 %	0 %	50 %	50 %	325113166
3529	NC_015178	GC	3	6	168205	168210	0 %	0 %	50 %	50 %	325113166
3530	NC_015178	TCG	2	6	168257	168262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113166
3531	NC_015178	GCC	2	6	168263	168268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113166
3532	NC_015178	GCG	2	6	168298	168303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113166
3533	NC_015178	CCT	2	6	168306	168311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325113166
3534	NC_015178	CG	3	6	168356	168361	0 %	0 %	50 %	50 %	325113166
3535	NC_015178	CGGC	2	8	168421	168428	0 %	0 %	50 %	50 %	325113166
3536	NC_015178	CCGT	2	8	168518	168525	0 %	25 %	25 %	50 %	325113166
3537	NC_015178	GCC	2	6	168535	168540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113166
3538	NC_015178	GTG	2	6	168566	168571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325113166
3539	NC_015178	TGG	2	6	168588	168593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325113166
3540	NC_015178	CCGG	2	8	168622	168629	0 %	0 %	50 %	50 %	325113166
3541	NC_015178	GCA	2	6	168687	168692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113166
3542	NC_015178	TCG	2	6	168701	168706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113166
3543	NC_015178	GCC	2	6	168757	168762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113166
3544	NC_015178	GCA	2	6	168773	168778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113166
3545	NC_015178	T	6	6	168801	168806	0 %	100 %	0 %	0 %	325113166
3546	NC_015178	CGC	2	6	168856	168861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113166
3547	NC_015178	AGC	2	6	168899	168904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113166
3548	NC_015178	CG	3	6	168928	168933	0 %	0 %	50 %	50 %	325113166
3549	NC_015178	CG	3	6	169025	169030	0 %	0 %	50 %	50 %	325113166
3550	NC_015178	GAT	2	6	169054	169059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325113166
3551	NC_015178	GCA	2	6	169125	169130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113166
3552	NC_015178	CG	3	6	169143	169148	0 %	0 %	50 %	50 %	325113166
3553	NC_015178	CGTT	2	8	169151	169158	0 %	50 %	25 %	25 %	325113166
3554	NC_015178	GCT	2	6	169171	169176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113166
3555	NC_015178	TCGA	2	8	169235	169242	25 %	25 %	25 %	25 %	325113166
3556	NC_015178	CCA	2	6	169269	169274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325113166
3557	NC_015178	CAC	2	6	169351	169356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325113166
3558	NC_015178	GCCG	2	8	169380	169387	0 %	0 %	50 %	50 %	325113166
3559	NC_015178	TGA	2	6	169401	169406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325113166
3560	NC_015178	CGCC	2	8	169433	169440	0 %	0 %	25 %	75 %	325113166
3561	NC_015178	TCGGTG	2	12	169445	169456	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	325113166
3562	NC_015178	CG	3	6	169485	169490	0 %	0 %	50 %	50 %	325113166
3563	NC_015178	GCC	2	6	169586	169591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113166
3564	NC_015178	GCC	2	6	169612	169617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113166
3565	NC_015178	GAT	2	6	169626	169631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325113166
3566	NC_015178	ATC	2	6	169634	169639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325113166
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3568	NC_015178	GC	3	6	169764	169769	0 %	0 %	50 %	50 %	325113166
3569	NC_015178	GC	3	6	169787	169792	0 %	0 %	50 %	50 %	325113166
3570	NC_015178	GTC	2	6	169793	169798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113166
3571	NC_015178	GAT	2	6	169861	169866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325113166
3572	NC_015178	TGCG	3	12	169868	169879	0 %	25 %	50 %	25 %	325113166
3573	NC_015178	GCC	2	6	169891	169896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113166
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3576	NC_015178	CG	3	6	169934	169939	0 %	0 %	50 %	50 %	325113166
3577	NC_015178	CGC	2	6	169956	169961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113166
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3579	NC_015178	CCA	2	6	169980	169985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325113166
3580	NC_015178	TGA	2	6	170022	170027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325113166
3581	NC_015178	CCGC	2	8	170028	170035	0 %	0 %	25 %	75 %	325113166
3582	NC_015178	GCC	2	6	170066	170071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113166
3583	NC_015178	TCT	2	6	170106	170111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325113166
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3585	NC_015178	ATC	2	6	170197	170202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325113166
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3587	NC_015178	CAG	2	6	170239	170244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113166
3588	NC_015178	GCA	2	6	170294	170299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113166
3589	NC_015178	CGC	2	6	170344	170349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113166
3590	NC_015178	TCC	2	6	170357	170362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325113166
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3593	NC_015178	C	6	6	170460	170465	0 %	0 %	0 %	100 %	325113166
3594	NC_015178	GGGCC	2	10	170644	170653	0 %	0 %	60 %	40 %	325113166
3595	NC_015178	CCTT	2	8	170699	170706	0 %	50 %	0 %	50 %	325113166
3596	NC_015178	GCC	2	6	170707	170712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113166
3597	NC_015178	TCGG	2	8	170810	170817	0 %	25 %	50 %	25 %	325113166
3598	NC_015178	CGCT	2	8	170941	170948	0 %	25 %	25 %	50 %	325113166
3599	NC_015178	CGGCG	2	10	171085	171094	0 %	0 %	60 %	40 %	325113166
3600	NC_015178	CGC	2	6	171173	171178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113166
3601	NC_015178	CGG	2	6	171183	171188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113166
3602	NC_015178	CCCG	2	8	171232	171239	0 %	0 %	25 %	75 %	325113166
3603	NC_015178	CGG	2	6	171250	171255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113166
3604	NC_015178	CGC	2	6	171273	171278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113166
3605	NC_015178	GGC	2	6	171307	171312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113166
3606	NC_015178	CAG	2	6	171376	171381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113166
3607	NC_015178	CCA	2	6	171420	171425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325113166
3608	NC_015178	GCC	2	6	171427	171432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113166
3609	NC_015178	CAA	2	6	171444	171449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325113166
3610	NC_015178	CGG	2	6	171553	171558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113166
3611	NC_015178	GCA	2	6	171561	171566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113166
3612	NC_015178	CGG	2	6	171593	171598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113166
3613	NC_015178	CATCCT	2	12	171660	171671	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	325113166
3614	NC_015178	CAC	2	6	171694	171699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325113166
3615	NC_015178	CGC	2	6	171700	171705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113166
3616	NC_015178	GCC	2	6	171710	171715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113166
3617	NC_015178	CCG	2	6	171720	171725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113166
3618	NC_015178	CAT	2	6	171726	171731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325113166
3619	NC_015178	TCA	2	6	171765	171770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325113166
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3621	NC_015178	CG	3	6	171843	171848	0 %	0 %	50 %	50 %	325113166
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3623	NC_015178	CGC	2	6	171997	172002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113166
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3746	NC_015178	GC	3	6	177837	177842	0 %	0 %	50 %	50 %	325113173
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3867	NC_015178	CTG	2	6	183288	183293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113177
3868	NC_015178	GAC	2	6	183302	183307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113177
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3980	NC_015178	GC	4	8	186911	186918	0 %	0 %	50 %	50 %	325113180
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3984	NC_015178	TGC	2	6	187086	187091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113180
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3988	NC_015178	CGG	2	6	187215	187220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113180
3989	NC_015178	AGCC	2	8	187264	187271	25 %	0 %	25 %	50 %	325113180
3990	NC_015178	GC	3	6	187330	187335	0 %	0 %	50 %	50 %	325113181
3991	NC_015178	TCGC	2	8	187338	187345	0 %	25 %	25 %	50 %	325113181
3992	NC_015178	GCA	2	6	187412	187417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113181
3993	NC_015178	CCG	2	6	187441	187446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113181
3994	NC_015178	CAG	3	9	187458	187466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113181
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3997	NC_015178	CCGC	2	8	187544	187551	0 %	0 %	25 %	75 %	325113181
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3999	NC_015178	CG	3	6	187569	187574	0 %	0 %	50 %	50 %	325113181
4000	NC_015178	CGA	2	6	187592	187597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113181

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